科学发展观是指导发展的科学世界观和方法论，是新世纪新阶段加强国防和军队建设的重要指导方针。在民兵预备役建设中，要真正把科学发展观贯穿于实际工作的方方面面，统筹协调民兵预备役建设中的各种关系，减少相关因素的互相影响和制约，实现全面协调可持续发展，应着力处理好以下四个方面的关系。
    处理好抓武装工作与服务经济建设的关系。坚持国防建设与经济建设协调发展，是党和国家确定的民兵预备役工作的基本方针。军分区、人武部是同级地方党委的军事部和同级地方政府的兵役机关，这种工作职责和性质决定了军分区、人武部要自觉接受双重领导，肩负双重责任。正确处理好抓武装工作与服务经济建设的关系，也就成为两级军事机关党委应着重把握的问题。面对这种情况，一定要保持清醒头脑，理清工作思路，分清主次关系，狠抓主要矛盾，兼顾各个方面，突出职能使命，要在自觉服从和维护大局的基础上，把主要精力放在抓好武装工作和提高民兵、预备役部队的战斗力上。要坚决防止“军分区不务军、人武部不抓武”的现象，切实把做好军事斗争准备作为工作的重中之重，立足现有条件高标准完成各项工作任务。
    处理好抓机关建设与抓基层建设的关系。基层是民兵预备役建设的基础，是工作落实的终端。贯彻落实科学发展观，最终要落实到基层全面建设的实践中，体现在基层建设的成效上。这几年，军分区、人武部党委机关，大力加强自身建设，谋划和指导基层建设的能力有了明显提高。但比较而言，在加强民兵预备役基层建设上，与基层需要和《纲要》要求还有明显差距，民兵预备役建设的标准和质量长期在低层次上徘徊，与打赢要求不相适应。因此，应当以科学发展观为指导，在抓好党委机关建设的同时，严格按照基层建设《纲要》，扎实做好抓基层打基础的工作；要努力克服下不去、蹲不住、抓不实的问题，切实做到领导精力向基层集中、工作重心向基层转移、钱物投入向基层倾斜，把基层作为各级党委机关干事创业的前沿阵地和广阔舞台，努力实现以机关建设的成果带动基层建设的发展，以基层建设的发展促进机关建设的进步。
    处理好继承传统与自主创新的关系。继承是发展的基础，创新是发展的动力。多年来，军分区、人武部两级党委在领导民兵预备役建设进程中，形成了一些行之有效的制度，总结出了一些宝贵的经验。这是集体智慧的结晶，一定要很好地继承和发扬。随着形势的发展变化，面对世界新军事变革的挑战，民兵预备役建设面临着许多新情况、新问题，这就要求我们必须在继承和发扬传统的同时，坚持用科学的世界观、方法论去研究和探索，努力寻求新的对策，解决新的问题，创造新的业绩，实现新的发展，积极谋求民兵预备役建设的全面进步。
    处理好抓当前工作与抓长远发展的关系。当前工作是长远发展的基础，长远发展是当前工作的远景。始终立足当前去着眼长远发展，才能登高望远，总揽全局，保持单位建设和改革的正确方向。民兵预备役建设是一个不断发展变化的动态系统工程。这就要求我们，搞建设必须既立足当前，又着眼长远，防止急功近利，搞出名挂号；既要打好基础，又要考虑发展，防止短期行为，搞形象工程；既要让领导认可，又要让官兵满意，防止脱离实际，搞劳民伤财。要树立“当一任领导、负长远责任”的思想，把当前建设项目和长远发展目标有机结合起来，善于用长远目标牵动当前工作，切实做到干着本届、想着后任，多做前人栽树、后人乘凉的工作，不断增强民兵预备役建设发展的潜力和后劲。